会計ソフトで医療費を入力する方法｜勘定科目の選び方と仕訳のコツ

「事業用の口座から病院代を払ったけど、会計ソフトにどう入力すればいいの？」そんな疑問を持っている個人事業主やフリーランスの方は多いはずです。

医療費の会計処理は、事業の経費になるケースとならないケースで入力方法がまったく異なります。ここを間違えると、帳簿がグチャグチャになったり、確定申告で余計な手間が増えたりするので注意が必要です。

この記事では、freee・マネーフォワード・弥生といった主要な会計ソフトでの医療費の入力方法を、勘定科目の選び方から仕訳例まで丁寧に解説します。医療費控除を活用した節税のポイントもあわせて紹介するので、ぜひ最後まで読んでみてください。

ナビ助

医療費の入力って、実は勘定科目さえ分かれば難しくないんだ。個人事業主の場合とか従業員がいる場合で使い分けが必要だから、ここでしっかり整理していこう！

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個人事業主の医療費は経費になる？ならない？

個人の医療費は「事業主貸」で処理する

まず大前提として、個人事業主本人やその家族の医療費は、事業の経費にはなりません。これは所得税法上、個人的な支出として扱われるためです。

事業用の口座や現金から医療費を支払った場合、会計ソフトでは「事業主貸」という勘定科目を使って記帳します。事業主貸とは、事業のお金をプライベートな目的で使ったことを記録するための科目です。

ポイント

仕訳例：事業用口座から自分の病院代1万円を支払った場合

借方：事業主貸 10,000円
貸方：普通預金 10,000円

摘要：○○クリニック診察代

このように入力しておけば、事業の経費としては計上されず、あくまで「個人的な支出」として正しく記録されます。

医療費が経費になるケース

一方で、以下のようなケースでは医療費を事業の経費として計上できます。

従業員の健康診断費用（全従業員に実施した場合）→ 勘定科目は「福利厚生費」
従業員の業務中のケガに関する治療費 → 勘定科目は「福利厚生費」
法人の場合の役員・従業員の人間ドック費用（条件あり）→ 勘定科目は「福利厚生費」

ただし、従業員がいない個人事業主（自分ひとりで事業をしている方）の場合、福利厚生費として計上する余地はほとんどありません。自分自身の健康診断費用も経費対象外です。

主要な会計ソフト別の入力方法

freeeでの入力手順

freee会計で医療費（事業主貸）を入力する方法は以下のとおりです。

「取引」→「取引の一覧・登録」を開く
「支出」を選択する
勘定科目で「事業主貸」を選ぶ
金額と日付を入力する
摘要に「○○病院診察代」などと記載する
口座を「事業用口座」に設定して登録する

freeeは銀行口座やクレジットカードと連携している場合、支払い明細が自動で取り込まれます。取り込まれた明細に対して勘定科目を「事業主貸」に設定するだけなので、手入力より効率的です（freeeヘルプセンター）。

ナビ助

freeeは自動仕訳の候補を出してくれるけど、病院名だと「事業主貸」じゃなくて別の科目が候補に出ることもあるから、自分で選び直すのが大事だよ！

マネーフォワードでの入力手順

マネーフォワードクラウド確定申告での入力は次のステップになります。

「手動で仕訳」→「振替伝票入力」を選択する
借方の勘定科目に「事業主貸」を入力する
貸方の勘定科目に「普通預金」（または「現金」）を入力する
金額・日付・摘要を入力して登録する

マネーフォワードも銀行明細の自動取り込みに対応しています。取り込まれた明細を仕訳する際に、科目を「事業主貸」に設定すればOKです（マネーフォワードクラウド公式）。

弥生会計での入力手順

やよいの青色申告オンライン・やよいの白色申告オンラインでは、以下の手順で入力します。

「かんたん取引入力」画面を開く
「支出」タブを選択する
取引の種類で「事業主貸」を選ぶ（プライベートの支出として入力）
金額・日付・摘要を入力して登録する

弥生は「かんたん取引入力」の画面で科目を選ぶだけなので、簿記の知識がなくても直感的に操作できます（弥生公式サイト）。

医療費控除との関係を理解しましょう

医療費控除とは

個人事業主の医療費は経費にならなくても、確定申告で「医療費控除」として所得から差し引ける可能性があります。これは事業の経費とは別の控除制度です。

ポイント

医療費控除の基本条件

年間の医療費が10万円を超えた場合（または所得の5%を超えた場合）
控除の上限は200万円
本人だけでなく、生計を同一にする家族の医療費も合算できる

セルフメディケーション税制も選択肢

医療費が10万円に届かない場合でも、ドラッグストアで購入した特定のOTC医薬品が年間1万2,000円を超えていれば、セルフメディケーション税制を活用できます。

ただし、医療費控除とセルフメディケーション税制の併用はできないため、どちらか有利な方を選択する必要があります。

会計ソフトでの医療費控除の入力

医療費控除は事業の帳簿ではなく、確定申告書の所得控除の欄で入力します。

freee：確定申告書作成画面の「所得控除」→「医療費控除」から入力
マネーフォワード：確定申告書作成時の「医療費控除」タブから入力
弥生：確定申告書作成画面の「所得控除」→「医療費控除」から入力

いずれのソフトも、医療費の明細を入力すると自動で控除額を計算してくれます。病院の領収書は手元に保管しつつ、明細を1件ずつ入力していきましょう。

ナビ助

ちなみに、医療費控除の明細書は国税庁のサイトからダウンロードできるんだ。健康保険組合の「医療費のお知らせ」があれば、まとめて記載できるから楽だよ。

よくある間違いと注意点

間違い1：個人の医療費を「医療費」で計上してしまう

会計ソフトの勘定科目に「医療費」という項目が存在する場合がありますが、これは法人向けの科目です。個人事業主が自分の医療費を「医療費」で入力すると経費に計上されてしまい、帳簿が正しくなくなります。

注意

個人事業主本人の医療費は、どの会計ソフトを使っていても勘定科目は「事業主貸」です。「医療費」「雑費」「その他経費」などで入力しないように気をつけましょう。

間違い2：プライベート用の口座での支払いを記帳してしまう

プライベート用の口座やポケットマネーから医療費を支払った場合は、そもそも会計ソフトへの入力は不要です。帳簿に記録するのは、事業用の口座・現金・クレジットカードからの支出だけです。

間違い3：医療費控除のために帳簿に「経費」として入力してしまう

医療費控除を受けるからといって、帳簿上で経費として入力する必要はありません。医療費控除は確定申告書の「所得控除」の欄で別途申告するものです。

従業員がいる場合の医療費の仕訳

健康診断費用の入力

従業員全員に健康診断を受けさせた場合、その費用は「福利厚生費」として経費に計上できます。

ポイント

仕訳例：従業員3人分の健康診断費用4万5,000円を事業用口座から支払った場合

借方：福利厚生費 45,000円
貸方：普通預金 45,000円

摘要：従業員健康診断費用（○○クリニック）

ただし、事業主本人の健康診断費用は含められないので注意が必要です。また、一部の従業員だけに受けさせた場合は「給与」として扱われる可能性があります。

業務中のケガの治療費

従業員が業務中にケガをして治療費を会社が負担した場合も、「福利厚生費」で処理します。労災保険が適用される場合は、保険金の受け取りも帳簿に記録する必要があります。

医療費の領収書を効率的に管理するコツ

レシート撮影機能を活用する

freeeやマネーフォワードには、スマホで領収書を撮影するとOCR機能で金額を自動読み取りしてくれる機能があります。医療費の領収書をもらったら、その場で撮影しておくとあとが楽です。

月ごとにまとめて入力する

医療費の支出が多い方は、月に1回まとめて入力するのがおすすめです。1年分をまとめて入力しようとすると、領収書を紛失していたり金額を忘れていたりするリスクが高まります。

「医療費のお知らせ」を活用する

健康保険組合から届く「医療費のお知らせ（医療費通知）」は、医療費控除の申告に使えます。記事執筆時点では、マイナポータルと連携することで自動的にデータを取り込むことも可能です。

ナビ助

マイナポータルの「わたしの情報」から医療費のデータを見られるんだよね。確定申告の時期にまとめてチェックするのもアリだけど、普段からこまめに領収書を撮影しておくともっと楽だよ。

Q&Aコーナー

Q. 歯の治療費（自費診療のインプラントなど）は経費になる？

個人事業主本人の治療費であれば、自費診療でも事業の経費にはなりません。ただし、インプラントや自費の歯科治療は医療費控除の対象になる場合があります。美容目的の歯科治療（ホワイトニングなど）は医療費控除の対象外です。

Q. 通院のための交通費は経費になる？

事業に直接関係する移動ではないので、経費にはなりません。ただし、通院のための公共交通機関の交通費は医療費控除に含めることができます。タクシー代はやむを得ない場合のみ対象です。

Q. 医薬品（市販薬）の購入費はどう入力する？

事業用の口座から支払った場合は「事業主貸」で入力します。セルフメディケーション税制の対象商品であれば、確定申告時に控除申告が可能です。対象商品にはレシートに目印が付いています。

Q. 法人化したら医療費の扱いは変わる？

法人の場合、役員や従業員の健康診断費用は「福利厚生費」として経費計上できます。ただし、役員のみを対象とした医療費は「役員報酬」扱いになる場合があるため、全社員を対象にすることが条件です。

1年分の医療費の領収書をどこに置くか

医療費控除は、本人だけでなく生計を同一にする家族の分も合算できます。つまり1年間で数十枚の領収書が家じゅうに散らばることになり、確定申告の直前に「あの月の分が見つからない」となりがちです。月別・人別に仕切れる領収書整理ファイルを1冊決めて、病院から帰ったらそこに入れるだけにしておくと、明細の入力がぐっと楽になります。

領収書の枚数がかなり多い方は、レシートサイズの読み取りに対応したコンパクトなスキャナーで月末にまとめてデータ化しておくという手もあります。実際の価格やレビューは各ショップで確認できます。

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